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①分離分析藥物的組合含量:由于一種藥劑常含有多組分,色譜方法是既能分離又能定量的方法。如脂溶性維生素片,含有鉻維生素,有C18柱及含1%碳酸銨的甲醇為流動相。一次即可將各維生素B6、D1、A、E同時分離并定出含量。又如止痛藥或退燒藥也可用此法分離并測得各組分的含量。
②藥物生產中進行中間控制:生產抗菌素時,首先要了解發酵液中的主體與付產物的存在情況。例如:青霉素、四環素、頭孢子菌素、紅霉素、柔紅霉素、慶大霉素等的發酵產物,均可用C18柱和甲醇及緩沖液配制的流動相或用離子對法,分析主體及其收產物的含量。對普魯卡因酰胺、茶堿等可進行主體含量的測定,對硝酸甘油可測定主體含量及其降解產物,以便保證藥物的熱量。
③分析藥物在體內的殘量:這是近來研究新藥效能很主要的內容之一,如冬凌草甲素是植物中的一組分,有抗癌效果,但是毒性大。測定其在血清中含量很重要,現在可用C18柱及甲醇水為流動相,測定處理后的血清樣品,即可得到血中的含量。如磺胺類藥品在血清及尿中含量也不允許太大,可用C18柱及酸性乙醇為流動相,測定含量后,則可估計合適的用藥劑量。又如四環素、巴比妥酸、止痛藥、退燒藥、護糖尿病的藥物等,在血或尿中的含量都可用C18柱用甲醇、水為流動相來測定含量。因此,反相色譜法應用范圍極廣。
④測定藥物在各種器官中的代謝產物,特別是研究藥物的代謝產物在血清中存在的情況。如測血清中的酮酸及戊二酸。測尿中代謝產物更為方便,不需要繁鎖的預處理。因為研究尿中的組分能鑒別病人的代謝功能,對病理研究或監床診斷均具有重要的參考價值。